Midgar, All-Girl Academy, teria sido notável apenas pela ação de aceitar seu primeiro e único estudante do sexo masculino, Yuu Mononobe. Mas Midgar se destaca por muito mais do que isso: é uma escola exclusiva de um grupo de meninas conhecidas como D's. Cada um deles tem habilidades extremamente poderosas na geração de matéria escura e manipula -a em armas poderosas.
Os D não existiam há vinte e cinco anos, e só apareceram depois que vários monstros misteriosos e destrutivos conhecidos como "Dragons" começaram a aparecer em todo o mundo. Estranhamente, tão de repente quanto eles apareceram, eles desapareceram. Em seu despertar destrutivo, algumas meninas começaram a nascer com símbolos em seus corpos e poderes de natureza semelhantes aos empunhados pelos próprios dragões.
Agora, os D frequentam esta escola, na esperança de aproveitar e utilizar seus poderes contra os dragões. Yuu é o seu mais recente membro e é extraordinário por ser o único homem conhecido em existência. Agora ele deve forjar relacionamentos com as meninas ao seu redor, incluindo sua irmã mais separada que também frequenta a escola e trabalhar com elas para investigar e eliminar a ameaça dos poderosos dragões.