Oito anos após os eventos de Macross F, um fenômeno misterioso conhecido como síndrome do Var consome gradualmente a galáxia. Cabe a uma nova geração de pilotos de Valkyrie altamente capazes de lidar com essa ameaça universal. E se eles ainda não tinham o suficiente no prato, a equipe de caça dos Cavaleiros Aéreos do Reino do Vento veio desafiar o esquadrão Delta.