Guerras ferroviárias! Ocorre em um universo alternativo onde o governo japonês permanece no controle dos sistemas ferroviários do país. Devido à estabilidade oferecida pela liderança do governo, o sistema ferroviário pode florescer.
Naoto Takayama aspira a se tornar um funcionário da Japan National Railways por causa da vida confortável que lhe permitirá viver. Para conseguir isso, ele entra em seu programa de treinamento, onde os alunos devem demonstrar seu conhecimento de trens, bem como sua capacidade de estar pronto para qualquer desafio que possa surgir.
Durante esse período, ele encontrará outros estudantes, como o Aoi Sakura, atleticamente talentoso, o Sho Iwaizumi, constantemente faminto, e a enciclopédia humana Haruka Komi. Juntos, eles trabalharão para sobreviver ao período de estagiário, o tempo todo assumindo assalto a assassinatos, ameaças de bomba e o espectro iminente do grupo "RJ" extremista que deseja privatizar o sistema ferroviário.