Amu Hinamori é estudante da Seiyo Elementary, onde tem a reputação de ser "legal e picante"; no entanto, sua verdadeira personalidade é a de uma garota extremamente tímida e facilmente intimidada. Uma noite, Amu deseja ter a coragem de renascer como ela "supostamente". Na manhã seguinte, Amu encontra três ovos de cores vivas – vermelho, azul e verde – em sua cama. Cada ovo eventualmente eclode em um personagem guardião: Ran, Miki e Su. Personagens Guardiões são seres semelhantes a anjos que ajudam uma pessoa a se tornar o que ela "seria" e a realizar seus sonhos. Os Personagens Guardiões conseguem isso dando incentivos e conselhos, mas também podem mudar temporariamente a personalidade e as habilidades de uma pessoa. Com os Personagens Guardiões, a vida de Amu se torna muito mais complexa enquanto ela agora luta para lidar com suas novas personalidades e os Guardiões Elementares Seiyo - um grupo do conselho estudantil onde cada membro tem seu próprio Personagem Guardião - que recruta Amu para procurar e selar os ovos X e os Personagens X, formas corrompidas dos sonhos das pessoas.
