"Schwarzesmarken", a palavra alemã para "Marcas Negras". Situado na década de 1980 em uma versão alternativa da linha do tempo da Alemanha Oriental, Schwarzesmarken segue o 666º Esquadrão TSF do Exército da Alemanha Oriental, também conhecido como "Marcas Negras". Esta unidade especial é especializada em táticas não convencionais utilizando tecnologia avançada. Seu inimigo? Seres de origem extraterrestre, ou BETA, um inimigo temível e às vezes imprevisível que parece decidido a destruir as forças humanas e a tomar o planeta Terra para si e a esvaziá-lo dos seus recursos naturais. Como os BETA existem em todas as formas e tamanhos, transportando inúmeras tecnologias alienígenas avançadas, os Black Marks devem usar as armas mais recentes e mortais que a humanidade possa conceber para os fazer recuar.
Irisdina Bernhard é a comandante das Marcas Negras. Como heroína de guerra, ela conquistou o respeito de seu país. No entanto, seu exterior frio e sua personalidade tornam extremamente difícil trabalhar com ela, especialmente para um dos membros mais talentosos do esquadrão, Theodor Eberbach. Só o tempo dirá se as muitas batalhas travadas em conjunto trarão paz à terra e entre as muitas personalidades combatentes do 666º Esquadrão TSF.