Yato e Yukine finalmente consertaram seu relacionamento como deus e Regalia, e todos voltaram à sua vida diária. Yato continua sendo uma divindade menor e desconhecida que continua fazendo biscates por cinco ienes cada, na esperança de um dia ter milhões de fiéis e seu próprio grande santuário. Hiyori Iki ainda não teve sua alma solta consertada por Yato, mas ela aproveita a vida e se prepara para cursar o ensino médio mesmo assim.
Ocorrendo imediatamente após a primeira temporada, Noragami Aragoto investiga o passado complicado entre Yato e o deus da guerra Bishamon. A deusa guarda um rancor misterioso contra Yato, o que muitas vezes resulta em confrontos violentos entre eles. Não ajuda que o Regalia mais confiável e amado de Bishamon, Kazuma, pareça estar em dívida com Yato. Quando vidas estão em risco, desvendar esses mistérios e outros pode ser a única maneira de corrigir erros do passado.
[Escrito por MAL Rewrite]