Tenma Matsukaze é um novo aluno da Raimon Junior High. Por amor ao futebol, ele decide ingressar no time de futebol da escola, que ganhou reputação após o incrível desempenho apresentado dez anos antes no Football Frontier International, torneio que recebe os melhores times juvenis do mundo. Infelizmente, a outrora renomada escola não tem o espírito futebolístico de antes.
Isto se deve principalmente ao fato de que o futebol no Japão é agora controlado por uma entidade obscura conhecida como “Quinto Setor”. Sozinhos decidem o destino de cada partida, instruindo as equipes a vencer ou perder. As ações do Quinto Setor derrubaram os times de futebol do país, que não têm mais amor pelo jogo.
Tenma e seus companheiros tentarão mudar esse paradigma e lutar contra seus opressores malignos. Felizmente, eles não estarão sozinhos nesta batalha, pois receberão ajuda de um grupo conhecido como “Resistência”. Torça pelos meninos de Inazuma Eleven Go enquanto eles lutam pelo bom combate!
