Naru Sekiya é uma garota média de 14 anos com inteligência mediana, capacidade atlética mediana e talentos medianos. Certa vez, ela teve esperanças de que começar o ensino médio mudaria tudo isso. Infelizmente, a realidade não poderia estar mais longe da verdade e ela continua sendo uma flor da vida. Por que a vida real não pode ser como os contos de fadas, onde um belo príncipe tira uma pobre garota da obscuridade e a transforma em uma princesa deslumbrante?
Sua vida normal de estudante muda quando ela conhece uma garota loira dançando no topo do portão de um santuário. Naru presume que a garota é uma fada, mas acontece que ela também é apenas uma garota normal. Mas também acontece que ela é uma estudante transferida chamada Hana, da América, que se apaixonou pelo yosakoi, um tipo de dança, e veio para o Japão com a intenção de abrir seu próprio clube! Animada por ser colega de classe da garota que conheceu na noite anterior, Hana tenta recrutar Naru para se tornar o primeiro membro do novo clube yosakoi. Pena que a ideia de dançar na frente de todos a apavora! Hana conseguirá convencer Naru a ingressar no clube? Naru vai se apaixonar por yosakoi? Descubra em Hanayamata!
