Haruka Nanase adora água e é apaixonada por nadar. Na escola primária, ele competiu e venceu uma corrida de revezamento com seus três amigos Rin Matsuoka, Nagisa Hazuki e Makoto Tachibana. Depois de conquistarem a vitória no torneio, os quatro amigos seguiram caminhos separados. Anos depois, eles se reencontram como estudantes do ensino médio; no entanto, Rin não está nem aí para voltar a ser como as coisas costumavam ser. Ele não apenas frequenta uma escola diferente, mas a única coisa importante para ele é provar que é um nadador melhor que Haruka.
Após o amargo reencontro, Haruka, Nagisa e Makoto decidem formar o Iwatobi High School Swim Club, mas precisarão de um quarto membro se quiserem participar do próximo torneio. Entra Rei Ryuugazaki, um ex-membro da equipe de atletismo que Nagisa recruta. À medida que a hora da competição se aproxima, os quatro desenvolvem um vínculo estreito enquanto treinam intensamente para chegar ao topo e resolver as coisas entre Haruka e Rin de uma vez por todas.
[Escrito por MAL Rewrite]